Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms