Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms