| RUNX3 | Q13761 | SNORA70.9-201 | ENST00000384370 | 135 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC136624.1-201 | ENST00000400791 | 413 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096559.1-201 | ENST00000414086 | 399 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHEK2P3-201 | ENST00000416118 | 248 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2AM1P-201 | ENST00000422137 | 422 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354956.1-201 | ENST00000424487 | 467 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353689.2-201 | ENST00000433837 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PARGP1-202 | ENST00000440803 | 790 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEACAMP9-201 | ENST00000442990 | 513 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073072.2-201 | ENST00000447425 | 348 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CBX1P2-201 | ENST00000453841 | 458 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDKN3-205 | ENST00000458126 | 845 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027627.1-201 | ENST00000506895 | 753 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02200-202 | ENST00000508879 | 615 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093535.1-203 | ENST00000512500 | 730 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CA3-AS1-203 | ENST00000524052 | 430 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02463-201 | ENST00000546414 | 497 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01578-206 | ENST00000555520 | 977 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02188-201 | ENST00000562064 | 550 nt | TSL 4 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087283.1-201 | ENST00000604029 | 1074 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL627230.1-201 | ENST00000613077 | 211 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015712.7-201 | ENST00000615211 | 635 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591926.8-201 | ENST00000616876 | 211 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P1-201 | ENST00000624263 | 1081 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RYR3-202 | ENST00000415757 | 15557 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NSF-206 | ENST00000575068 | 2667 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DYNC1I2-202 | ENST00000397119 | 2604 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MEPE-202 | ENST00000395102 | 2123 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SH3YL1-203 | ENST00000403657 | 3540 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP1R9A-206 | ENST00000433360 | 5369 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL034549.2-201 | ENST00000618285 | 3373 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCOA3-201 | ENST00000371997 | 6750 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASP1-208 | ENST00000527979 | 1521 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTM1-203 | ENST00000370396 | 3593 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA15-201 | ENST00000607520 | 4325 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AXDND1-201 | ENST00000367618 | 3642 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNX10-202 | ENST00000396376 | 2491 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003973.3-201 | ENST00000624863 | 2822 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYB5AP4-201 | ENST00000396692 | 399 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092111.3-201 | ENST00000402465 | 496 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP114-201 | ENST00000410327 | 279 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BMS1P17-201 | ENST00000413661 | 723 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL26P29-201 | ENST00000415623 | 438 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00276-201 | ENST00000417751 | 596 nt | TSL 2 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139819.1-201 | ENST00000429420 | 471 nt | TSL 3 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX41-205 | ENST00000431734 | 529 nt | TSL 4 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073062.1-201 | ENST00000434509 | 455 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161722.2-201 | ENST00000434731 | 981 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RHOT1P3-201 | ENST00000436571 | 331 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRPF38AP2-201 | ENST00000438179 | 851 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092957.1-201 | ENST00000473299 | 570 nt | TSL 4 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC140172.1-201 | ENST00000502928 | 141 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLUD1P3-202 | ENST00000508551 | 200 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006427.1-201 | ENST00000514359 | 712 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079064.1-201 | ENST00000528365 | 362 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4A43P-201 | ENST00000532938 | 908 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049875.1-201 | ENST00000554328 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055855.2-201 | ENST00000565993 | 500 nt | TSL 2 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008814.1-201 | ENST00000603797 | 406 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01355-202 | ENST00000604481 | 400 nt | TSL 2 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026786.2-201 | ENST00000606110 | 392 nt | TSL 3 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018690.1-201 | ENST00000608144 | 626 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016590.3-201 | ENST00000611171 | 753 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012593.1-212 | ENST00000627058 | 580 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYOCOS-203 | ENST00000637303 | 564 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079298.1-201 | ENST00000625026 | 1619 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC1A2-203 | ENST00000395753 | 11689 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LCA5L-218 | ENST00000485895 | 2551 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AMY1B-201 | ENST00000330330 | 1862 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LCLAT1-203 | ENST00000379509 | 4888 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005212.5-201 | ENST00000577614 | 3505 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IRF5P1-201 | ENST00000504852 | 2164 nt | BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5B2-202 | ENST00000641342 | 2184 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAPVD1-206 | ENST00000394104 | 6737 nt | TSL 2 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TNFSF4-202 | ENST00000367718 | 3429 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPH1-201 | ENST00000250018 | 5325 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LMO3-209 | ENST00000447609 | 3365 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBPF19-201 | ENST00000369227 | 3670 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBPF20-203 | ENST00000594479 | 3670 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBPF14-210 | ENST00000621066 | 3670 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL7R-201 | ENST00000303115 | 4626 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AKAP6-212 | ENST00000557272 | 4601 nt | TSL 5 BASIC | 5.32 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AASDH-203 | ENST00000502617 | 3004 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02523-201 | ENST00000423208 | 2963 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NSUN3-201 | ENST00000314622 | 3289 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLCO1A2-212 | ENST00000458504 | 2008 nt | TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MUM1L1-202 | ENST00000357175 | 4173 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL3-217 | ENST00000514591 | 6297 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHRM2-203 | ENST00000445907 | 5918 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NOL4-203 | ENST00000538587 | 1979 nt | TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF181-203 | ENST00000459757 | 2265 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004158.1-201 | ENST00000564508 | 4319 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AMD1-204 | ENST00000368885 | 3438 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF630-207 | ENST00000616492 | 2220 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC38A1-211 | ENST00000612161 | 1607 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK10-236 | ENST00000638313 | 3971 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KYAT3-203 | ENST00000370491 | 1868 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR1L8-201 | ENST00000304865 | 1061 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPRR2G-201 | ENST00000368748 | 568 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP87-201 | ENST00000384155 | 118 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |