Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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