Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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