Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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