Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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