Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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EFEMP1Q12805 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EFEMP1Q12805 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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