Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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