Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APAF1O14727 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APAF1O14727 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
APAF1O14727 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
APAF1O14727 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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APAF1O14727 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
APAF1O14727 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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