Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms