Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms