Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nde1Q9CZA6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nde1Q9CZA6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms