Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms