Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms