Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms