Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL5Q93034 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL5Q93034 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms