Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM9

TRIM22, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM22, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM22Q8IYM9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM22Q8IYM9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM22Q8IYM9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms