Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms