Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYFIP1Q7L576 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms