Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SV2AQ7L0J3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms