Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms