Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms