Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt2Q3TTY5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms