Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKARP32238 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKARP32238 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms