Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms