Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms