Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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