Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms