Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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CUL4AQ13619 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4AQ13619 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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