Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNMO15061 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNMO15061 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNMO15061 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNMO15061 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SYNMO15061 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SYNMO15061 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNMO15061 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNMO15061 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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