Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms