Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms