Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms