Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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UBXN4Q92575 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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UBXN4Q92575 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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UBXN4Q92575 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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