Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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