Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC112Q8NEF3 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms