Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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