Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms