Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms