Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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