Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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