Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms