Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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PUM3Q15397 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PUM3Q15397 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PUM3Q15397 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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