Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
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BRD3Q15059 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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