| RUNX3 | Q13761 | CPS1-204 | ENST00000451903 | 4770 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF493-202 | ENST00000355504 | 4386 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIST1H2BD-201 | ENST00000289316 | 789 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10AG1-201 | ENST00000312345 | 1016 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAV25-201 | ENST00000390454 | 403 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SGMS2-203 | ENST00000394686 | 2127 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTERF4-204 | ENST00000406593 | 802 nt | TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYTOR-204 | ENST00000409898 | 560 nt | TSL 5 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNJ13-203 | ENST00000410029 | 1177 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP18-201 | ENST00000416139 | 468 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002064.2-201 | ENST00000420245 | 289 nt | TSL 3 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353608.2-201 | ENST00000425587 | 340 nt | TSL 5 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL034405.1-201 | ENST00000432062 | 526 nt | TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFA5P8-201 | ENST00000449019 | 346 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4435-2HG-214 | ENST00000453478 | 560 nt | TSL 4 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRBV2-201 | ENST00000455382 | 421 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353152.1-201 | ENST00000455973 | 470 nt | TSL 5 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P16-201 | ENST00000479738 | 738 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P25-201 | ENST00000486956 | 268 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUMO2P19-201 | ENST00000518920 | 295 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025437.5-201 | ENST00000522769 | 314 nt | TSL 3 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5D2P-201 | ENST00000524390 | 911 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DUXA-201 | ENST00000554048 | 1006 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EDDM3DP-201 | ENST00000554692 | 434 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00871-201 | ENST00000555246 | 408 nt | TSL 5 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ETFRF1-211 | ENST00000557540 | 1259 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NOP10-202 | ENST00000557912 | 436 nt | TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15A-203 | ENST00000563390 | 525 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NQO1-206 | ENST00000564043 | 892 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092132.1-201 | ENST00000570859 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007922.3-201 | ENST00000581648 | 543 nt | TSL 3 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006504.5-202 | ENST00000586784 | 656 nt | TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETSIP-202 | ENST00000596516 | 909 nt | APPRIS P2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OSER1-AS1-205 | ENST00000623343 | 827 nt | TSL 5 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112694.2-201 | ENST00000623697 | 768 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB30-212 | ENST00000533486 | 9929 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KYNUP3-201 | ENST00000574386 | 1341 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMMSON-210 | ENST00000641260 | 1308 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NXF4-202 | ENST00000416098 | 1465 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYNCRIP-204 | ENST00000616122 | 6764 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC12A6-216 | ENST00000560164 | 3744 nt | TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087258.1-203 | ENST00000545400 | 1629 nt | TSL 2 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNGA1-207 | ENST00000514170 | 2837 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF402P-201 | ENST00000404435 | 3100 nt | BASIC | 5.37 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAT1-201 | ENST00000295756 | 1919 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGSF10-201 | ENST00000282466 | 11067 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LIMA1-215 | ENST00000552823 | 3254 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103740.1-201 | ENST00000558888 | 7427 nt | TSL 2 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022893.1-201 | ENST00000517664 | 3549 nt | TSL 2 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGSF6-201 | ENST00000268389 | 2785 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFX-211 | ENST00000539115 | 6801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR11H6-201 | ENST00000315519 | 993 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP90-201 | ENST00000364801 | 99 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP17-201 | ENST00000414607 | 293 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASP12-208 | ENST00000448103 | 1071 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BIRC6-AS1-201 | ENST00000455572 | 697 nt | TSL 3 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASP12-210 | ENST00000494737 | 961 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02506-201 | ENST00000513211 | 734 nt | TSL 3 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098829.1-202 | ENST00000513384 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA26.10-201 | ENST00000516427 | 141 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C14orf105-210 | ENST00000534126 | 1030 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC144836.1-201 | ENST00000575911 | 340 nt | TSL 2 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBL5-207 | ENST00000590068 | 390 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138035.1-202 | ENST00000604669 | 683 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000904.1-201 | ENST00000609911 | 951 nt | TSL 3 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THRA1/BTR-204 | ENST00000621191 | 513 nt | TSL 5 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010809.3-201 | ENST00000621310 | 641 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP5A1P1-201 | ENST00000454088 | 1321 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1P36-201 | ENST00000427807 | 1351 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C5orf51-204 | ENST00000612065 | 1391 nt | TSL 5 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGS6-204 | ENST00000404301 | 1497 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGS6-206 | ENST00000407322 | 1497 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8G5-203 | ENST00000641992 | 1560 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCOA4P2-201 | ENST00000340589 | 1813 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIPEPP2-201 | ENST00000422560 | 1819 nt | BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TERB1-203 | ENST00000558713 | 2257 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SELL-201 | ENST00000236147 | 2436 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHRM3-AS2-201 | ENST00000427859 | 2431 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MCM9-209 | ENST00000619706 | 4822 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.36 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PFKFB2-202 | ENST00000367080 | 7094 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATF2-201 | ENST00000264110 | 4176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LMO3-225 | ENST00000541295 | 3498 nt | TSL 2 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10G4-203 | ENST00000641722 | 3301 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPY6R-202 | ENST00000510937 | 2988 nt | TSL 3 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFP42-201 | ENST00000326866 | 2651 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM197Y3-202 | ENST00000427622 | 2325 nt | TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM197Y7-202 | ENST00000433321 | 2325 nt | TSL 2 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TET1-201 | ENST00000373644 | 9288 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CABS1-201 | ENST00000273936 | 1532 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012618.3-205 | ENST00000637896 | 1496 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMD13-201 | ENST00000370668 | 1403 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EOGT-209 | ENST00000540955 | 1332 nt | TSL 2 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5AS1-201 | ENST00000313555 | 975 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.28-201 | ENST00000391249 | 210 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPIAP9-201 | ENST00000403866 | 498 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX6B1P1-201 | ENST00000415962 | 213 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390036.1-201 | ENST00000419428 | 734 nt | TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590399.2-201 | ENST00000427536 | 309 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KNOP1P3-201 | ENST00000446933 | 426 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592431.1-201 | ENST00000451090 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |