Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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