Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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HOXD10P28358 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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HOXD10P28358 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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HOXD10P28358 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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