Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SCN2BO60939 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCN2BO60939 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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