Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TTF2Q9UNY4 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms