Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CIPCQ9C0C6 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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